常用的消毒方法大致可分为三类，即物理消毒法、化学消毒法和生物学消毒法。

（1）物理消毒法

是指用物理因素杀灭或消除病原微生物及其他有害微生物的方法。其特点是作用迅速，消毒物品不遗留有害物质。常用的物理消毒法有：自然净化、机械除菌、热力灭菌和紫外线辐射等。

（2）化学消毒法

是指用化学药品进行消毒的方法。化学消毒法使用方便，不需要复杂的设备，但某些消毒药品有一定的毒性和腐蚀性，为保证消毒效果，减少毒副作用，须严格按照要求的条件和使用说明。

（3）生物学消毒法

是利用某些生物消灭致病微生物的方法。特点是作用缓慢，效果有限，但费用较低。多用于大规模废物及排泄物的卫生处理，常用的方法有生物热消毒技术和生物氧化消毒技术。