黄芪在春、秋二季采挖比较好。

人工栽培的黄芪以生长3、4年的质量最好，生产中也有2年采挖的，但药材质量欠佳，一般是生长3年采挖，采挖时间应该选在黄芪休眠期到萌动期，此时黄芪有效成分黄芪甲苷含量比较高，所以应在10月末11月初或3月末4月初两季采挖。

黄芪采挖时应先割除地上部分，然后逐穴、逐行将根挖出，注意不要将根挖断，以免影响产量和质量。黄芪根圆柱形，有的有分枝，上端较粗，略扭曲，长30～90cm，直径0.7～3.5cm，表面淡棕黄色至淡棕褐色，有不规则纵皱纹及横长皮孔，栓皮易剥落而露出黄白色皮部，有的可见网状纤维束，质坚韧，断面强纤维性，气微，味微甜，有豆腥味。