塔尔寺是宗喀巴大师罗桑扎巴诞生地。宗喀巴大师早年学经于夏琼寺，16岁去西藏深6年后，其母香萨阿切盼儿心切，让人捎去一束白发和一封信，要宗喀巴回家一晤。宗喀巴为学佛教决意不返，给母亲和姐姐各捎去自画像和狮子吼佛像1幅，并写信“若能在我出生地用十万狮子吼佛像和菩提树修建一座佛塔，就如与我见面一样”。明洪武十二年，香萨阿切在信徒们支持下建塔，取名“莲聚塔”。此后塔多次改建维修，万历十年，三世达赖向仁钦宗哲坚赞及当地申中、西纳、祁家、龙本、米纳等藏族部落昂索指示扩建塔尔寺，赐赠供奉佛像，并进行各种建寺仪式。从此，塔尔寺发展很快，先后建成达赖行宫、三世达赖灵塔殿、九间殿、依怙殿、释迦殿等。经四世达赖指示，万历四十年正月，正式建立显宗学院，讲经开法，标志着塔尔寺成为格鲁派的正规寺院。这就是塔尔寺的由来。