南红玛瑙和玛瑙的区别在于原石、颜色、质地的不同，南红玛瑙通常外部是红肉，内部是冻肉，纹路在转折时十分的明显，颜色鲜艳，美观性较强，质地透亮接近玉石，玛瑙则是内外部结构一致，呈现玻璃质感。

南红玛瑙通常是外部红肉，里面是冻肉，纹路十分的锐利，纹路在转折等时候会有明显的角度，十分清晰，其他玛瑙则是内外结构一致，这也是判断南红玛瑙玉玛瑙区别之一。

南红玛瑙相比其他玛瑙更加鲜艳，比普通的红玛瑙也好看的多，美观性强，南红玛瑙具有一定的油性，把玩时间越长柱子也就越红亮有光泽。而普通玛瑙的颜色相对于暗淡。

南红玛瑙和玛瑙的质地也有所不同，南红玛瑙虽属于玛瑙的一种，但质地更接近玉石，仔细观察时会发现色彩呈现透亮状态，其他玛瑙则是充满玻璃感，这也是判断南红玛瑙的方法之一。